開発

生体分子モデリングのための汎用計算フレームワーク。

RDKit を利用した、2D 分子構造のインタラクティブビューア。

RDF Portal 用の MCP サーバー。

ケミカルスペースを対話的に探索する marimo ノートブック。公式の examples ギャラリーに採用されました。

高速な SASA（溶媒接触表面積）計算ツール。Python バインディング付き。

高性能な分子動力学トラジェクトリ解析ライブラリ。

タンパク質二次構造割り当て（DSSP）の Zig 実装。

mmCIF/PDBx 辞書の定義を引く CLI ツール。

SMILES/InChI などから 3D 配座を ChimeraX 内で生成（RDKit、ネットワーク不要）。

VS Code 用 mmCIF のレインボー構文ハイライト＋辞書ホバー。

Neovim 用 mmCIF のレインボー列ハイライト。

PDB データから Mine スキーマの PostgreSQL DB を構築（RDKit 化学検索対応）。

PDB CCD ファイルを RDKit 分子に変換する軽量ライブラリ／CLI。

marimo で作るケミカルスペースのビューア。